Markus Amrein hat nach seiner Lehre zum Hochbauzeichner an der Fachhochschule Aargau in Brugg-Windisch Architektur studiert. Parallel zu seiner achtjährigen Tätigkeit als Architekt erwarb Markus Amrein ein Diplom als Energieexperte Bau an der FHNW.
Seit 2009 ist Markus Amrein bei Energie Zukunft Schweiz für Energieberatungen und Bauherrenbegleitungen zuständig.
Seine Freizeit verbringt er am liebsten mit seiner Familie, im Garten, mit Architektur und mit Aktivitäten im oder am Wasser.